LEAF

Leaf – samodzielne budowanie kohort pacjentów

W Interdyscyplinarnym Pomorskim Centrum Medycyny Cyfrowej wdrożyliśmy Leaf – otwarte (open-source) narzędzie do interaktywnego budowania kohort pacjentów. Dzięki niemu badacze mogą samodzielnie, bez znajomości SQL i bez pośrednictwa zespołu IT, przeszukiwać zasoby danych klinicznych i w kilka chwil zdefiniować grupę pacjentów spełniających interesujące ich kryteria, np. rozpoznania, wyniki badań laboratoryjnych, przyjmowane leki, wykonane procedury czy dane demograficzne.

 

Architektura integracji Leaf z hurtownią danych (Enterprise Data Warehouse) i systemem REDCap. Źródło: JAMIA, 2020.

Najważniejsze zalety

Intuicyjny interfejs wizualny


kohortę buduje się klikając, stopniowo zawężając kryteria i natychmiast widząc liczebność grupy

Samoobsługowość


badacz pracuje niezależnie, co skraca czas od pomysłu do oceny wykonalności badania (feasibility)

Niezależność od modelu danych


Leaf jest model-agnostic, więc działa na różnych strukturach danych (m.in. OMOP CDM, i2b2) i można go podłączyć do istniejącej hurtowni danych

Bezpieczeństwo i kontrola dostępu


zapytania podlegają uprawnieniom, a na etapie eksploracji wyniki mają charakter zagregowany

Otwartość


jako projekt open-source, Leaf może być swobodnie rozwijany i dostosowywany do lokalnych potrzeb