Muzeum Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego działa od 2006 roku. Gromadzi i prezentuje obiekty związane z historią i tradycją Uczelni od 1945 roku. W zbiorach znajdują się również eksponaty pochodzące z Wydziału Lekarskiego Uniwersytetu Stefana Batorego w Wilnie z lat 1919-1939 oraz obiekty związane z medycyną gdańską od XVI wieku. Wśród nich znajdują się dokumenty, książki, sprzęt medyczny i aptekarski oraz inne zabytki kultury materialnej związane z historią Uczelni, medycyny, farmacji i nauki. Eksponaty, szczególnie te dotyczące historii najnowszej, pochodzą ze zbiorów klinik i katedr GUMed, a także od osób prywatnych – obecnych i byłych pracowników i absolwentów.