Obok wypełniania zadań dydaktycznych i badawczych, Gdański Uniwersytet Medyczny pełni rolę organu założycielskiego dla czterech podmiotów leczniczych, w tym dwóch szpitali klinicznych – Uniwersyteckiego Centrum Klinicznego w Gdańsku oraz Uniwersyteckiego Centrum Medycyny Morskiej i Tropikalnej w Gdyni. To wysokospecjalistyczne placówki o najwyższym stopniu referencyjności, tzn. oferujące najwyższy ze wszystkich poziom opieki. Szpitale GUMed gwarantują unikatowe nie tylko w Polsce północnej możliwości lecznicze w zakresie m.in. przeszczepienia wielonarządowe (serce, nerki, płuca, wątroba, wyspy trzustkowe, rogówka, szpik), trombektomii mechanicznej, radioterapii i chemioterapii onkologicznej, hematologii dziecięcej i dorosłych, kardiologii inwazyjnej i elektrokardiologii, a także medycyny hiperbarycznej i chorób tropikalnych.
